18 мая 2010 года Беспалов был задержан по подозрению в хищении из регионального бюджета денежных средств на сумму более миллиона рублей. Вторым фигурантом этого дела стал профессор общего и славяно-русского языкознания Волгоградского государственного педагогического университета Василий Супрун. Дело в том, что по версии следствия, именно он заключал контракты с московскими фирмами, через которые было похищено около двух миллионов рублей.
В отношении бывшего вице-губернатора Виктора Беспалова и Василия Супруна возбуждено уголовное дело по признакам состава преступлений, предусмотренных ч.4 ст.159 УК РФ (мошенничество) и ст.292 УК РФ (должностной подлог). На данный момент следствие пытается доказать, что в 2008 году по указанию Беспалова руководитель ГОУ «Волгоградская академия повышения квалификации и переподготовки работников образования» Василий Супрун заключил фиктивные контракты с двумя московскими коммерческими организациями по оказанию образовательных услуг на сумму 1 089 865 рублей.
Согласно заключенным контрактам эти фирмы должны были провести анкетирование, ознакомительные семинары — тренинги, лекции, оказать консалтинговые услуги. На сегодняшний же момент проводится лишь обучение преподавателей Волгоградской области по методическому пособию «Школьная медиация». При этом обучение проводят штатные преподаватели государственных образовательных учреждений, труд которых оплачивается по бюджетным расценкам. То есть по стоимости это не превышает несколько тысяч рублей.
Следствие собирает доказательства в пользу того, что работы по контрактам не были выполнены, но акты об их приемке подписаны были и бюджетные средства в размере более миллиона рублей переведены на счета московских фирм.